23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1065 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  100 
 
 
698 aa  1445    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  71.52 
 
 
712 aa  962    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  94.42 
 
 
699 aa  1337    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  39.29 
 
 
699 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  38.64 
 
 
698 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  37.71 
 
 
711 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1006  hypothetical protein  28.63 
 
 
950 aa  120  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.601621  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1920  hypothetical protein  30.85 
 
 
719 aa  101  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20490  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  25.22 
 
 
670 aa  95.1  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0140  protein of unknown function DUF324  24.05 
 
 
615 aa  92.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1374  hypothetical protein  28.68 
 
 
756 aa  84.7  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0183  cold-shock DNA-binding protein family protein  28.73 
 
 
882 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1832  hypothetical protein  28.79 
 
 
666 aa  78.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2524  hypothetical protein  26.55 
 
 
744 aa  70.9  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1246  hypothetical protein  27.19 
 
 
719 aa  64.7  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.534306  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0185  hypothetical protein  29.65 
 
 
319 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1679  hypothetical protein  22.22 
 
 
501 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.6131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0362  hypothetical protein  29.47 
 
 
321 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3214  hypothetical protein  24.6 
 
 
661 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  28.41 
 
 
330 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0987  protein of unknown function DUF324  28.46 
 
 
331 aa  48.5  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1148  hypothetical protein  25.1 
 
 
796 aa  45.4  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1798  putative CRISPR-associated RAMP family protein  28.79 
 
 
339 aa  43.9  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>