17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1576 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1576  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  157  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0281  hypothetical protein  78.38 
 
 
75 aa  123  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0200  hypothetical protein  59.46 
 
 
75 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.717937 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0841  hypothetical protein  52.7 
 
 
75 aa  90.5  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.159049  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0897  hypothetical protein  54.05 
 
 
75 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4620  hypothetical protein  42.19 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2629  hypothetical protein  41.94 
 
 
74 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1398  hypothetical protein  40.98 
 
 
73 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0527  hypothetical protein  39.34 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0399  hypothetical protein  40.98 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1114  hypothetical protein  37.5 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02183  hypothetical protein  44.74 
 
 
55 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.85763  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1660  hypothetical protein  40.74 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.414948 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0222  hypothetical protein  40.68 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0222  hypothetical protein  38.98 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1470  hypothetical protein  37.78 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>