16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0872 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0872  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  932    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0833922  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2007  hypothetical protein  69.62 
 
 
455 aa  666    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1894  hypothetical protein  25.94 
 
 
440 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.999283  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1452  hypothetical protein  23.84 
 
 
441 aa  94  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4870  hypothetical protein  24.05 
 
 
451 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0697  hypothetical protein  24.94 
 
 
468 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1810  hypothetical protein  22.96 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3997  hypothetical protein  23.25 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.200317  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1840  hypothetical protein  23.39 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835777  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2105  hypothetical protein  24.02 
 
 
434 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843241  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3924  hypothetical protein  21.7 
 
 
438 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647872  hitchhiker  0.00979003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3770  hypothetical protein  23.77 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00806133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0417  AAA ATPase  24.14 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3933  hypothetical protein  21.44 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.218593  unclonable  0.0000403133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1557  hypothetical protein  22.61 
 
 
450 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.283773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2892  hypothetical protein  20.92 
 
 
443 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>