18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8952 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8952  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292057  normal  0.503616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2640  hypothetical protein  40.91 
 
 
175 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2274  hypothetical protein  33.92 
 
 
174 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0145177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2966  hypothetical protein  33.92 
 
 
174 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2467  hypothetical protein  38.82 
 
 
189 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2755  hypothetical protein  33.96 
 
 
171 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.141041  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2966  hypothetical protein  33.96 
 
 
171 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000452312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3004  hypothetical protein  35.03 
 
 
172 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157923  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2683  hypothetical protein  33.96 
 
 
171 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2963  hypothetical protein  33.96 
 
 
171 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003837 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2704  hypothetical protein  32.9 
 
 
171 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2757  hypothetical protein  31.68 
 
 
167 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000181447  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1029  hypothetical protein  41.72 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0294615  decreased coverage  0.00421364 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1944  hypothetical protein  29.52 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0567  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0546  hypothetical protein  31.61 
 
 
160 aa  79  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.203884  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1145  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1146  hypothetical protein  39.39 
 
 
110 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>