12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7945 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7945  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  353  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1202  hypothetical protein  43.59 
 
 
100 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1838  hypothetical protein  40.21 
 
 
179 aa  51.6  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.450169  normal  0.227053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2146  hypothetical protein  38.75 
 
 
126 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00360758  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2799  hypothetical protein  54.17 
 
 
119 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.374089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2519  hypothetical protein  33.67 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19450  hypothetical protein  43.14 
 
 
99 aa  42.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.735309  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1095  DivIVA domain protein  39.06 
 
 
125 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06340  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0650  hypothetical protein  36.36 
 
 
167 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192275  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3020  hypothetical protein  32.65 
 
 
136 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0497  hypothetical protein  35.56 
 
 
174 aa  41.2  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>