20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6546 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6546  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  197  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0240638  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6639  hypothetical protein  75.51 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0807  secreted protein  35.56 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3183  hypothetical protein  36.67 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1804  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2357  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0871  hypothetical protein  36.36 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0934  hypothetical protein  57.14 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.860281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6840  secreted protein  57.89 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04280  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0767  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1190  hypothetical protein  35.44 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1937  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20896  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26160  hypothetical protein  31.52 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17500  hypothetical protein  41.33 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0260  hypothetical protein  35.71 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0485  hypothetical protein  34.25 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  50 
 
 		 486 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1316  hypothetical protein  40.48 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3199  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000230213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>