12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6542 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6542  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.222472  normal  0.072913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2269  hypothetical protein  52.2 
 
 		 181 aa  147  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000385921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6977  hypothetical protein  48.47 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3084  hypothetical protein  43.48 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.254427  hitchhiker  0.00915514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2132  hypothetical protein  44.72 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.985668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0178  hypothetical protein  40.13 
 
 		 186 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31931  normal  0.732129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4807  hypothetical protein  40.4 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20110  hypothetical protein  34.84 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0332257  hitchhiker  0.00184991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00530  hypothetical protein  35.57 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1746  hypothetical protein  31.61 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00373634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16690  hypothetical protein  37.98 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0403  hypothetical protein  28.15 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.41355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>