14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6195 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6195  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  340  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1334  hypothetical protein  40.74 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6728  hypothetical protein  30.13 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00401956  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1555  hypothetical protein  29.8 
 
 
170 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2490  hypothetical protein  31.62 
 
 
158 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4079  hypothetical protein  29.73 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741455  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4567  hypothetical protein  29.25 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1322  hypothetical protein  29.25 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2478  hypothetical protein  24.1 
 
 
294 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545885  normal  0.0244888 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1462  hypothetical protein  32.2 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1377  hypothetical protein  32.2 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.600318  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3868  hypothetical protein  26.35 
 
 
156 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1365  hypothetical protein  31.36 
 
 
158 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3753  hypothetical protein  26.21 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000185967  normal  0.115536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>