18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6168 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6168  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  585  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132354  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0562  hypothetical protein  50.35 
 
 
294 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11170  hypothetical protein  49.83 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0898011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3276  hypothetical protein  48.29 
 
 
298 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0282  hypothetical protein  46.18 
 
 
294 aa  232  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1075  hypothetical protein  39.24 
 
 
286 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5087  hypothetical protein  35.96 
 
 
296 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.692279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6450  hypothetical protein  37.02 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0170653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4541  hypothetical protein  33.99 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3163  hypothetical protein  35.19 
 
 
302 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0045094  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13860  hypothetical protein  30.61 
 
 
286 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5307  hypothetical protein  34.53 
 
 
299 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522562  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1177  hypothetical protein  33.91 
 
 
305 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2014  hypothetical protein  28.99 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1564  hypothetical protein  44.12 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.234397  normal  0.812381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0531  hypothetical protein  30.91 
 
 
306 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2209  hypothetical protein  30.7 
 
 
314 aa  49.7  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000355617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0384  hypothetical protein  30.6 
 
 
290 aa  45.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.585903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>