13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5232 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5232  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1493  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  46.61 
 
 
633 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8370  putative secreted protein  37.64 
 
 
259 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3471  hypothetical protein  33.86 
 
 
646 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.245401  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5309  putative secreted protein  32.06 
 
 
190 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5233  putative chaplin  61.19 
 
 
79 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9225  hypothetical protein  29.24 
 
 
532 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0146  surface protein  30.58 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5349  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  0.183228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0126  hypothetical protein  32.37 
 
 
352 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0192432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3396  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.84 
 
 
485 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7049  hypothetical protein  27.46 
 
 
1020 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1097  hypothetical protein  30.23 
 
 
512 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>