12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4898 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4898  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  887    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2024  hypothetical protein  37 
 
 
467 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534725  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1116  hypothetical protein  29.93 
 
 
484 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1144  hypothetical protein  29.16 
 
 
499 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.548609  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1940  hypothetical protein  26.42 
 
 
467 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342271  normal  0.555742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1419  hypothetical protein  38.36 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2985  hypothetical protein  26.89 
 
 
501 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1558  hypothetical protein  28.69 
 
 
403 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1329  hypothetical protein  25.06 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.295723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5148  hypothetical protein  32.21 
 
 
479 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1894  hypothetical protein  30.19 
 
 
462 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.557849  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0682  hypothetical protein  31.47 
 
 
442 aa  46.6  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>