34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3192 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  47.62 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  44.55 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  44.44 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  39.5 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002785  hypothetical protein  41.09 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  35.9 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03196  hypothetical protein  42.62 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1839  hypothetical protein  38.89 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2167  hypothetical protein  37.4 
 
 		 123 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2497  hypothetical protein  37.17 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1825  hypothetical protein  37.17 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0194222  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1788  hypothetical protein  37.17 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  39.5 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1781  hypothetical protein  37.17 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0111743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2872  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1645  hypothetical protein  37.8 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2439  hypothetical protein  37.3 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1647  hypothetical protein  41.33 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1969  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00366875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2349  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0136957  decreased coverage  0.000000000361738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2421  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0112375  hitchhiker  0.000913176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1693  hypothetical protein  38.67 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1915  hypothetical protein  38.66 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  30.97 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  35.96 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0557  Protein of unknown function DUF2069, membrane  31.03 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  31.13 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  26.09 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  35.42 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  28.85 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  28.91 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  31.31 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  31.31 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>