20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1649 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1649  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  562  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.432038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1612  hypothetical protein  29.75 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0261  hypothetical protein  28.39 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0074  hypothetical protein  27.45 
 
 		 309 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000070418  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08196  hypothetical protein  26.69 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000170796  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0566  hypothetical protein  27.65 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00656687 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0653  hypothetical protein  26.87 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.395081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0798  hypothetical protein  24.83 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0056  hypothetical protein  25.56 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0963  hypothetical protein  27.61 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2315  hypothetical protein  23.4 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  hitchhiker  0.000000000000558489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02980  hypothetical protein  22.26 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1885  hypothetical protein  24.62 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911612 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2823  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2563  hypothetical protein  28.5 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3495  hypothetical protein  22.99 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2026  hypothetical protein  25.23 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0240  hypothetical protein  34.34 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6250  hypothetical protein  23.56 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4716  hypothetical protein  25.55 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.428888  normal  0.0726517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>