16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1469 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1469  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  567  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0620928  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1741  hypothetical protein  97.54 
 
 
285 aa  553  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3232  hypothetical protein  34.78 
 
 
286 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3373  hypothetical protein  30.82 
 
 
301 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3223  hypothetical protein  27.78 
 
 
340 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.551897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4329  hypothetical protein  32.52 
 
 
282 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.208394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3455  hypothetical protein  30.77 
 
 
283 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0573  hypothetical protein  29.57 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0681  hypothetical protein  28.23 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0684  hypothetical protein  28.23 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.92177 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1245  hypothetical protein  26.64 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1128  hypothetical protein  21.3 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0225553  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2951  hypothetical protein  19.2 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000000390561  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2998  hypothetical protein  23.91 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00377147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2408  hypothetical protein  18.99 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2430  hypothetical protein  23.78 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.91793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>