20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0298 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0298  uncharacterized membrane protein, putative  100 
 
 		 532 aa  1025    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0303  putative ABC transporter permease protein  98.31 
 
 		 532 aa  1013    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2039  hypothetical protein  26.24 
 
 		 559 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00195767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1890  hypothetical protein  26.77 
 
 		 552 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3340  hypothetical protein  25.48 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3361  hypothetical protein  26.64 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3386  hypothetical protein  26.64 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.743067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3033  ABC transporter permease  26.64 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000402188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3126  ABC transporter permease  26.64 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3139  hypothetical protein  26.64 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3062  putative ABC transporter, permease  26.45 
 
 		 554 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00181769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3364  hypothetical protein  26.42 
 
 		 552 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2121  putative ABC transporter, permease  24.51 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3356  hypothetical protein  26.64 
 
 		 552 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173371  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1688  hypothetical protein  23.3 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15300  hypothetical protein  23.98 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0542  hypothetical protein  26.22 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.237787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0196  putative ABC transporter, permease protein  22.92 
 
 		 532 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0408  hypothetical protein  24.41 
 
 		 553 aa  57  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4673  hypothetical protein  22.38 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>