27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2869 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2869  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  387  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1364  putative proton-coupled thiamine transporter YuaJ  36.46 
 
 
231 aa  124  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0128009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1622  putative proton-coupled thiamine transporter YuaJ  36.46 
 
 
231 aa  124  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0335216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10030  putative proton-coupled thiamine transporter YuaJ  36.84 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0166  proton-coupled thiamine transporter YuaJ  36.69 
 
 
181 aa  109  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0037  proton-coupled thiamine transporter YuaJ  35.75 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0633  putative proton-coupled thiamine transporter YuaJ  40.11 
 
 
212 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0280  proton-coupled thiamine transporter YuaJ  36.6 
 
 
185 aa  98.2  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0729  proton-coupled thiamine transporter YuaJ  32.95 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2120  proton-coupled thiamine transporter YuaJ  34.91 
 
 
181 aa  84.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000587957  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0275  proton-coupled thiamine transporter YuaJ  36.11 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3476  putative proton-coupled thiamine transporter YuaJ  31.49 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0359  hypothetical protein  32.02 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4644  putative proton-coupled thiamine transporter YuaJ  34.21 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1529  hypothetical protein  33.9 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.419261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5066  hypothetical protein  28.82 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4930  probable proton-coupled thiamine transporter YuaJ  28.82 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4705  hypothetical protein  28.82 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4935  probable proton-coupled thiamine transporter YuaJ  30 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4562  thiamine transporter  28.24 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0482993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0304  probable proton-coupled thiamine transporter YuaJ  30 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4950  probable proton-coupled thiamine transporter YuaJ  29.41 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4967  hypothetical protein  29.41 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4544  thiamine transporter  28.24 
 
 
222 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0817  hypothetical protein  35.07 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1261  thiamine transporter  36.08 
 
 
265 aa  50.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00651567  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl035  unknown transporter protein  25.48 
 
 
217 aa  41.6  0.007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>