17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1741 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1741  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  567  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1469  hypothetical protein  97.54 
 
 
285 aa  553  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0620928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3232  hypothetical protein  33.81 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3373  hypothetical protein  30.14 
 
 
301 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4329  hypothetical protein  32.17 
 
 
282 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.208394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3223  hypothetical protein  27.16 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.551897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3455  hypothetical protein  30.77 
 
 
283 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0573  hypothetical protein  29.57 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0681  hypothetical protein  27.82 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0684  hypothetical protein  27.82 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.92177 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1245  hypothetical protein  26.64 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1128  hypothetical protein  21.66 
 
 
268 aa  62.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0225553  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3043  hypothetical protein  18.75 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0033024  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2998  hypothetical protein  23.55 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00377147  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2951  hypothetical protein  18.75 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000000390561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2430  hypothetical protein  24.13 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.91793 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2408  hypothetical protein  18.99 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>