11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01200 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK01200  expressed protein  100 
 
 
758 aa  1571    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_17702  predicted protein  26.32 
 
 
411 aa  105  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.257016 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44277  predicted protein  23.43 
 
 
368 aa  80.1  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00437  DNA repair protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04570)  27.12 
 
 
845 aa  78.2  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775561  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32290  predicted protein  26.01 
 
 
684 aa  72.8  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_3060  predicted protein  25.83 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.206644  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47094  predicted protein  22.67 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40815  predicted protein  30.72 
 
 
182 aa  61.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0533421  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56782  predicted protein  23.9 
 
 
628 aa  55.5  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10962  interstrand crosslink repair protein (Eurofung)  20.85 
 
 
832 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04070  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 
811 aa  49.3  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.96924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>