19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1678 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1678  ribosome-binding factor A  100 
 
 
120 aa  248  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00355813  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1492  ribosome-binding factor A  73.5 
 
 
122 aa  186  7e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000665731  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0356  ribosome-binding factor A  70.94 
 
 
121 aa  183  6e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.186334  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1496  ribosome-binding factor A  70.94 
 
 
121 aa  183  6e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.107589  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0223  ribosome-binding factor A  67.24 
 
 
120 aa  170  5e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.120167  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0132  ribosome-binding factor A  67.24 
 
 
120 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0150  ribosome-binding factor A  67.24 
 
 
120 aa  167  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0611436  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0172  ribosome-binding factor A  67.24 
 
 
120 aa  167  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.562977  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0249  ribosome-binding factor A  52.99 
 
 
125 aa  140  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.526887  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0677  ribosome-binding factor A  40.52 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0327  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  28.28 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  27.59 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  27.59 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  27.59 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  27.59 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  27.59 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  46.88 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1413  ribosome-binding factor A  28.3 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>