27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1112 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1112  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
197 aa  401  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0711  thioredoxin domain-containing protein  49.72 
 
 
198 aa  184  9e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1061  possible periplasmic thioredoxin  46.89 
 
 
205 aa  164  9e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0059  thioredoxin domain-containing protein  41.41 
 
 
198 aa  159  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.457756  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1628  thioredoxin domain-containing protein  40.5 
 
 
201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.325697  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0694  hypothetical protein  39.39 
 
 
199 aa  152  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1249  thioredoxin domain-containing protein  40.4 
 
 
200 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1124  thioredoxin domain-containing protein  40.91 
 
 
200 aa  148  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0616  thioredoxin domain-containing protein  39.9 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.28635  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0844  putative lipoprotein thiredoxin  31.44 
 
 
185 aa  95.5  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0882  Redoxin domain protein  29.41 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1396  thiredoxin  29.9 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0500  thiredoxin  31.03 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1341  putative lipoprotein  26.63 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1222  putative lipoprotein  26.63 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0521  putative lipoprotein  26.13 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.747119  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1311  transporter  28.93 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0971109  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1212  conserved hypothetical lipoprotein  28.02 
 
 
181 aa  61.6  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1491  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.44 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.327411 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1328  thiredoxin  23.5 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.33 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.47 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.97 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.55 
 
 
187 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  28.38 
 
 
421 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.19 
 
 
183 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  24.56 
 
 
188 aa  41.6  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>