13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1090 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1090  integral membrane protein  100 
 
 		 277 aa  526  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0867  permease  45.22 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0091  hypothetical protein  40.93 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0084  hypothetical protein  40.57 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.773078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0109  hypothetical protein  38.36 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0476827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7126  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.21 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.93 
 
 		 296 aa  181  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.755088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4335  hypothetical protein  39.79 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.723653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0202  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251862  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12723  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2510  hypothetical protein  23 
 
 		 293 aa  49.3  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1431  hypothetical protein  22.22 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2483  membrane protein containing DUF6  20.26 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.886177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>