20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13248 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13248  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  164  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3369  hypothetical protein  75 
 
 
79 aa  114  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01038  hypothetical protein  66.67 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0473132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5375  hypothetical protein  55.95 
 
 
84 aa  88.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3807  hypothetical protein  51.81 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3850  hypothetical protein  55 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0876589  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  53.09 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0085  hypothetical protein  49.44 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0262  hypothetical protein  45.45 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.623777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16910  hypothetical protein  51.69 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331531  normal  0.123249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0873  hypothetical protein  51.69 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0159931  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3839  hypothetical protein  55.68 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.106509  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0296  hypothetical protein  46.34 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1565  hypothetical protein  48.89 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.679201  hitchhiker  0.00228497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4747  hypothetical protein  48.15 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917471  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1968  hypothetical protein  43.21 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128383  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3626  hypothetical protein  63.41 
 
 
74 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  60 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4856  hypothetical protein  55.56 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.620342  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  35.29 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>