22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07475 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07475  putative S1/P1 Nuclease  100 
 
 
268 aa  556  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0543  S1/P1 nuclease  40.52 
 
 
266 aa  199  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00211  putative S1/P1 Nuclease  39.26 
 
 
268 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0162  S1/P1 nuclease  35.32 
 
 
268 aa  178  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0244  S1/P1 nuclease  37.24 
 
 
256 aa  172  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863137  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3221  S1/P1 nuclease  36.4 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0707943  normal  0.405467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0491  S1/P1 nuclease  30.53 
 
 
253 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0943322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02316  endonuclease  34.24 
 
 
257 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0551  S1/P1 nuclease  30.92 
 
 
285 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.976409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2113  S1/P1 nuclease  30.58 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.420885  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2020  S1/P1 nuclease  31.67 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304833  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2128  hypothetical protein  27.97 
 
 
280 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.491143  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9277  predicted protein  29.83 
 
 
308 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.509446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1877  S1/P1 nuclease  29.63 
 
 
307 aa  99.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0607718 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02540  conserved hypothetical protein  34.33 
 
 
393 aa  92.4  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1528  hypothetical protein  24.71 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1455  hypothetical protein  24.12 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0027  hypothetical protein  26.41 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5343  phospholipase C/P1 nuclease domain-containing protein  28.41 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.298135 
 
 
-
 
NC_003296  RS01677  putative signal peptide protein  23.79 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1908  hypothetical protein  30.77 
 
 
321 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110697  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2882  hypothetical protein  23.76 
 
 
332 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.22442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>