19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00925 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00925  beta carotene hydroxylase  100 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5618  fatty acid hydroxylase  52 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2038  beta-carotene hydroxylase  55.63 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0223903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2033  fatty acid hydroxylase  54.61 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0059  carotene hydroxylase  51.01 
 
 		 146 aa  150  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2089  fatty acid hydroxylase  51.77 
 
 		 152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.213926  normal  0.0390398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5702  fatty acid hydroxylase  43.05 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1168  carotene hydroxylase  44.9 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2128  carotene hydroxylase  42.86 
 
 		 200 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4535  carotene hydroxylase  38.57 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1710  fatty acid hydroxylase  39.42 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  0.199306 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0702  fatty acid hydroxylase  38.76 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0482  fatty acid hydroxylase  34.72 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1074  carotene hydroxylase  40.16 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2665  fatty acid hydroxylase  29.53 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3246  beta-carotene hydroxylase  27.63 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2516  carotene hydroxylase  31.47 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2647  fatty acid hydroxylase  29.61 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.810487  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_9013  predicted protein  33.66 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252602  normal  0.0220603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>