32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1159 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1159  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  259  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5447  hypothetical protein  90.7 
 
 
129 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5292  hypothetical protein  70.42 
 
 
142 aa  189  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.109135 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2985  hypothetical protein  57.03 
 
 
125 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3110  hypothetical protein  57.03 
 
 
125 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1333  hypothetical protein  57.03 
 
 
293 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.784002  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6075  hypothetical protein  63.89 
 
 
124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0756645 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5478  hypothetical protein  68.54 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2289  hypothetical protein  60.19 
 
 
175 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6485  hypothetical protein  55.47 
 
 
122 aa  127  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0097127  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5608  hypothetical protein  69.66 
 
 
118 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1344  hypothetical protein  55.47 
 
 
122 aa  127  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.431742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5768  hypothetical protein  60.58 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.959428 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6338  hypothetical protein  68.54 
 
 
118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864224  normal  0.10452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4511  hypothetical protein  67.06 
 
 
109 aa  114  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19335  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4202  hypothetical protein  65.12 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4312  hypothetical protein  65.12 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257675  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3717  hypothetical protein  58.62 
 
 
95 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6781  hypothetical protein  55.91 
 
 
96 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406722  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4293  hypothetical protein  55.17 
 
 
95 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0793  hypothetical protein  57.47 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.321671  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5906  hypothetical protein  60.24 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4526  hypothetical protein  46.46 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.540117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1295  hypothetical protein  52.33 
 
 
92 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920283  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1598  hypothetical protein  49.44 
 
 
92 aa  94  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.215399  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00670  hypothetical protein  48.45 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2153  hypothetical protein  51.22 
 
 
94 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0837  hypothetical protein  50.57 
 
 
100 aa  88.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2127  hypothetical protein  48.78 
 
 
94 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1063  hypothetical protein  48.84 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.513514  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1866  hypothetical protein  52.94 
 
 
75 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3634  hypothetical protein  53.7 
 
 
54 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00027053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>