25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0297 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0297  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246483  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0123  hypothetical protein  64.12 
 
 
280 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3001  hypothetical protein  66.53 
 
 
273 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3066  hypothetical protein  66.53 
 
 
273 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1536  hypothetical protein  66.53 
 
 
273 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3920  hypothetical protein  66.27 
 
 
264 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3304  hypothetical protein  66.53 
 
 
264 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3992  hypothetical protein  65.06 
 
 
264 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2627  hypothetical protein  53.57 
 
 
269 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.433366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1493  hypothetical protein  51.98 
 
 
262 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3259  hypothetical protein  64.63 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2069  hypothetical protein  46.22 
 
 
277 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1483  hypothetical protein  28.23 
 
 
250 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0247  hypothetical protein  37.33 
 
 
258 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1830  hypothetical protein  32.31 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2427  hypothetical protein  35.87 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2861  hypothetical protein  26.98 
 
 
258 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613567  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4569  hypothetical protein  25 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7643  hypothetical protein  33.85 
 
 
266 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2527  hypothetical protein  28.86 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35785  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2011  hypothetical protein  28.02 
 
 
254 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3192  hypothetical protein  29.78 
 
 
254 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157621  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0115  hypothetical protein  26.24 
 
 
254 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0967  hypothetical protein  29.11 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3575  hypothetical protein  25.67 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal  0.671981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>