65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2503 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2503  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1734  hypothetical protein  92.12 
 
 
165 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216168  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1660  hypothetical protein  84.24 
 
 
165 aa  295  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0922603  normal  0.0534906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2506  hypothetical protein  80 
 
 
165 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0773  hypothetical protein  79.63 
 
 
165 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1831  hypothetical protein  79.63 
 
 
189 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1246  hypothetical protein  79.63 
 
 
165 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1983  hypothetical protein  79.63 
 
 
189 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1731  hypothetical protein  79.63 
 
 
189 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0389  hypothetical protein  79.63 
 
 
165 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1814  hypothetical protein  79.01 
 
 
189 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1534  hypothetical protein  76.36 
 
 
165 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1558  hypothetical protein  76.36 
 
 
165 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1078  hypothetical protein  76.36 
 
 
165 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4700  hypothetical protein  75.15 
 
 
165 aa  258  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.786571  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1480  hypothetical protein  73.94 
 
 
165 aa  254  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1459  hypothetical protein  73.94 
 
 
165 aa  254  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1674  hypothetical protein  74.55 
 
 
165 aa  253  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1747  hypothetical protein  54.32 
 
 
163 aa  174  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2914  hypothetical protein  52.76 
 
 
165 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963659  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2653  hypothetical protein  52.47 
 
 
165 aa  167  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86632  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2872  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1914  protein of unknown function DUF336  52.32 
 
 
178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.180095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29320  hypothetical protein  48.99 
 
 
166 aa  160  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2358  protein of unknown function DUF336  46.88 
 
 
172 aa  158  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.61424  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1996  hypothetical protein  47.4 
 
 
161 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0452  hypothetical protein  46.88 
 
 
172 aa  147  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5390  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  143  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1764  hypothetical protein  53.15 
 
 
160 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2342  hypothetical protein  44.81 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1766  hypothetical protein  41.83 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.267084  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003593  hypothetical protein  44.06 
 
 
158 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1367  hypothetical protein  42.95 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4513  hypothetical protein  42.76 
 
 
164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1411  hypothetical protein  42.31 
 
 
169 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.851451  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1243  hypothetical protein  37.58 
 
 
159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0924995 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3196  hypothetical protein  39.04 
 
 
216 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3449  hypothetical protein  39.04 
 
 
158 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3426  hypothetical protein  39.04 
 
 
158 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3104  hypothetical protein  39.04 
 
 
216 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3175  hypothetical protein  38.36 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000510798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3413  hypothetical protein  38.36 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1581  hypothetical protein  41.35 
 
 
171 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3106  hypothetical protein  39.04 
 
 
158 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1792  hypothetical protein  41.35 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3413  hypothetical protein  38.19 
 
 
206 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3401  hypothetical protein  38.19 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2291  protein of unknown function DUF336  42.65 
 
 
156 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0133  protein of unknown function DUF336  46.75 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1842  hypothetical protein  38.19 
 
 
158 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.935839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1852  hypothetical protein  36.81 
 
 
182 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05610  hypothetical protein  38.89 
 
 
155 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237845  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4062  hypothetical protein  40.52 
 
 
155 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.628231  normal  0.565272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1397  hypothetical protein  39.71 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.851845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0937  hypothetical protein  40.44 
 
 
164 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415514  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4563  hypothetical protein  38.69 
 
 
164 aa  97.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172322  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1419  hypothetical protein  40.44 
 
 
164 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0245  protein of unknown function DUF336  39.16 
 
 
155 aa  95.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1338  hypothetical protein  38.3 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1896  hypothetical protein  35.51 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1299  hypothetical protein  35.1 
 
 
172 aa  87.8  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66044  predicted protein  33.33 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.148486  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2865  protein of unknown function DUF336  30.71 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0168022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12350  hypothetical protein  32.64 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  36.54 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>