19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1858 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1858  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  234  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5568  hypothetical protein  50.81 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1142  hypothetical protein  51.35 
 
 
106 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71833  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0455  hypothetical protein  51.82 
 
 
153 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0159  hypothetical protein  50 
 
 
166 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1021  hypothetical protein  50 
 
 
166 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1328  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2754  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2612  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0185  hypothetical protein  49 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6000  hypothetical protein  48.18 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4013  hypothetical protein  46.36 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4354  hypothetical protein  46.36 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155471  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4237  hypothetical protein  41.82 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257801  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1666  hypothetical protein  50 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0340303  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3763  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4848  cold-shock DNA-binding domain protein  37.61 
 
 
207 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00619999  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4090  cold-shock DNA-binding protein family protein  27.83 
 
 
188 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.25862 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2438  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  27.5 
 
 
182 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>