34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1192 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1192  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  254  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476297  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4171  hypothetical protein  81.89 
 
 
127 aa  207  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0787775  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1172  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  84.25 
 
 
126 aa  206  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3416  hypothetical protein  81.89 
 
 
127 aa  206  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199537  normal  0.0728248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2345  hypothetical protein  85.71 
 
 
127 aa  206  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000024781  unclonable  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1264  hypothetical protein  84.13 
 
 
127 aa  201  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1406  putative secreted protein  80.31 
 
 
126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0449246  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1634  hypothetical protein  57.48 
 
 
126 aa  138  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0443  hypothetical protein  54.24 
 
 
125 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59860  putative type III effector Hop protein  46.94 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114799  hitchhiker  0.000000000000152109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3015  hypothetical protein  40.78 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4507  hypothetical protein  51.25 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0956  hypothetical protein  56.25 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2194  hypothetical protein  47.06 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2386  hypothetical protein  48.91 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0869  hypothetical protein  42.71 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36200  Plasmid hypothetical protein, RAQPRD  44.09 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1450  hypothetical protein  53.03 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0675  hypothetical protein  53.42 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2940  hypothetical protein  47.62 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2851  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  48.65 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3322  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840275  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1975  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.793487  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0510  hypothetical protein  45.36 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4094  hypothetical protein  47.62 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4177  hypothetical protein  47.62 
 
 
109 aa  60.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0329  hypothetical protein  45.05 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0368  hypothetical protein  57.78 
 
 
203 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0652  hypothetical protein  35 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3713  hypothetical protein  32.65 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0640  hypothetical protein  32.63 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1756  hypothetical protein  30.77 
 
 
107 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0682  hypothetical protein  35.79 
 
 
100 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3933  hypothetical protein  37.88 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>