16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1178 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1178  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  228  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1250  hypothetical protein  80.67 
 
 
119 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3430  hypothetical protein  72.95 
 
 
119 aa  164  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692072  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4185  hypothetical protein  72.36 
 
 
123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295357  normal  0.923646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2359  hypothetical protein  77.12 
 
 
118 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686199  unclonable  0.000000113838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1392  hypothetical protein  75.61 
 
 
123 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2865  hypothetical protein  55.14 
 
 
114 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2400  hypothetical protein  63.06 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2180  hypothetical protein  62.16 
 
 
117 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1619  hypothetical protein  61.4 
 
 
116 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0689  hypothetical protein  52.25 
 
 
117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.293413  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0429  hypothetical protein  62.28 
 
 
116 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0942  hypothetical protein  58.41 
 
 
117 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0487  hypothetical protein  39.13 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36370  hypothetical protein  36.54 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1427  hypothetical protein  30.63 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.273174  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>