25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3737 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3737  DNA circulation-like  100 
 
 
415 aa  815    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2255  tail/DNA circulation protein  34.76 
 
 
446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4477  tail/DNA circulation protein  34.76 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2252  tail/DNA circulation protein  33.78 
 
 
446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2588  DNA circulation family protein  32.12 
 
 
438 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0328137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3864  phage FluMu DNA circulation protein, putative  33.71 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1158  DNA circulation-like  29.55 
 
 
411 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3117  DNA circulation family protein  43.15 
 
 
468 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2698  prophage MuSo2, DNA circulation protein, putative  26.37 
 
 
438 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3051  putative bacteriophage DNA circulation protein, Mu-like  37.5 
 
 
475 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.273853  hitchhiker  0.000025391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0581  DNA circulation protein, putative  41.22 
 
 
607 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4591  DNA circulation, N-terminal  38.93 
 
 
470 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422243  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2737  putative DNA circulation protein  42.75 
 
 
468 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2815  DNA circulation family protein  42.75 
 
 
468 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1469  putative DNA circulation protein  42.75 
 
 
468 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.539442 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0745  DNA circulation protein  26.09 
 
 
439 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0692  DNA circulation protein  26.09 
 
 
439 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6587  putative Mu-like prophage DNA circulation protein  29.25 
 
 
422 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1874  DNA circulation family protein  28.42 
 
 
490 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000818097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4486  Mu-like prophage DNA circulation protein-like protein  38.95 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126188  normal  0.0913206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0189  DNA circulation family protein  28.81 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0744  DNA circulation family protein  46.24 
 
 
446 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1654  DNA circulation family protein  48.48 
 
 
153 aa  67.4  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2088  hypothetical protein  32.63 
 
 
128 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2449  putative Mu-like prophage DNA circulation protein  30.28 
 
 
159 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>