12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3349 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3349  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  283  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  59.18 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1814  hypothetical protein  57.14 
 
 		 165 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4326  hypothetical protein  45.54 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3614  hypothetical protein  64 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  45.45 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5730  putative signal peptide protein  52.73 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0909  hypothetical protein  38.78 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4231  hypothetical protein  42.74 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1345  putative lipoprotein  45.45 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  44.83 
 
 		 687 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2301  hypothetical protein  60.98 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>