13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5916 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5916  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2116  hypothetical protein  75.76 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0388  hypothetical protein  75.37 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.639561  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3879  hypothetical protein  53.82 
 
 		 287 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5432  hypothetical protein  68.31 
 
 		 337 aa  258  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672203  normal  0.347111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0909  hypothetical protein  74.49 
 
 		 359 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0372  hypothetical protein  41.3 
 
 		 102 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.746188  normal  0.818485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  40.2 
 
 		 150 aa  53.5  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  38.54 
 
 		 1272 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  38.78 
 
 		 1082 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  37.78 
 
 		 2642 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3349  hypothetical protein  52.83 
 
 		 147 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.39 
 
 		 1769 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>