38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4478 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4478  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0790  hypothetical protein  96.92 
 
 
65 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185376  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3901  hypothetical protein  92.31 
 
 
65 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4493  hypothetical protein  64.62 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0075  hypothetical protein  64.81 
 
 
66 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.398237  normal  0.423709 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5821  hypothetical protein  68 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3933  hypothetical protein  67.35 
 
 
59 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3820  hypothetical protein  67.35 
 
 
59 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432882  normal  0.337677 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6400  hypothetical protein  53.23 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916024  normal  0.116761 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4526  hypothetical protein  54.84 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1446  hypothetical protein  49.21 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.55376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0939  hypothetical protein  46.03 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.02047  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2361  hypothetical protein  46.03 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2338  hypothetical protein  46.03 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1726  hypothetical protein  46.03 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5681  hypothetical protein  46.03 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150981  normal  0.858407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2377  hypothetical protein  46.03 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2257  hypothetical protein  46.03 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0271155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1358  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2470  hypothetical protein  52.08 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0836129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2108  hypothetical protein  46.81 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.22897 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1171  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0222478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0293  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.984016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1163  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0855  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1010  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.652393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1322  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1943  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3322  hypothetical protein  46.81 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443037  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1224  hypothetical protein  46.81 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0959  hypothetical protein  47.73 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.134343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1571  hypothetical protein  51.16 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.665593 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0282  membrane protein  46.51 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4609  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2025  hypothetical protein  58.97 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1076  hypothetical protein  36.76 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000323708  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0554  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0552955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6998  hypothetical protein  48.72 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.813818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>