42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3067 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  90.17 
 
 
234 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0687  putative transmembrane lipoprotein  68.78 
 
 
233 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  64.96 
 
 
237 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  68.87 
 
 
237 aa  291  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  68.4 
 
 
237 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  68.4 
 
 
237 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  68.4 
 
 
237 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  68.4 
 
 
237 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  68.4 
 
 
237 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  59.4 
 
 
233 aa  247  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  59.32 
 
 
236 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  58.55 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2379  hypothetical protein  62.68 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323215  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4127  hypothetical protein  57.99 
 
 
232 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  63.03 
 
 
236 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  63.03 
 
 
236 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  42.6 
 
 
222 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  42.04 
 
 
222 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  42.41 
 
 
213 aa  135  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  39.9 
 
 
223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  41.2 
 
 
216 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4994  putative lipoprotein  33.54 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2547  hitchhiker  0.00226373 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1658  putative lipoprotein  33.13 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2635  putative lipoprotein  32.31 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1667  putative lipoprotein  31.47 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801077  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0424  putative lipoprotein  31.47 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1689  putative lipoprotein  31.47 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1844  putative lipoprotein  31.47 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0739  putative lipoprotein  31.47 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1458  putative lipoprotein  31.47 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0925  putative lipoprotein  31.47 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  30.35 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4583  hypothetical protein  29.38 
 
 
204 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0957  hypothetical protein  28.25 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1439  hypothetical protein  28.25 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1417  hypothetical protein  28.25 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1358  hypothetical protein  27.86 
 
 
204 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234925  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2339  hypothetical protein  28.08 
 
 
217 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.039929  normal  0.763516 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1319  hypothetical protein  26.87 
 
 
204 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  22.71 
 
 
232 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1876  hypothetical protein  26.37 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>