36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1770 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1770  putative transmembrane protein  100 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2473  putative transmembrane protein  86.82 
 
 		 216 aa  347  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578174  normal  0.940793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1632  putative transmembrane protein  71.96 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1118  hypothetical protein  50 
 
 		 239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1598  hypothetical protein  50 
 
 		 239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4736  hypothetical protein  51.72 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.935032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1575  hypothetical protein  49.79 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1494  hypothetical protein  48.54 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2483  hypothetical protein  46.86 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2011  hypothetical protein  48.31 
 
 		 244 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1857  hypothetical protein  48.31 
 
 		 244 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1514  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1842  hypothetical protein  47.88 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1639  hypothetical protein  51.56 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0358  hypothetical protein  47.46 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.240886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0803  hypothetical protein  47.46 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1701  hypothetical protein  47.46 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1214  hypothetical protein  47.46 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0931852  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5516  hypothetical protein  32.8 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0876  hypothetical protein  29.41 
 
 		 330 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.423577  normal  0.480034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1601  hypothetical protein  33.87 
 
 		 196 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2187  hypothetical protein  29.84 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1360  hypothetical protein  36.43 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205277 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5890  hypothetical protein  29.84 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4922  hypothetical protein  29.69 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131667  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5458  hypothetical protein  29.19 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3017  hypothetical protein  40.91 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000243008  normal  0.0643153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00765  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.547305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2602  hypothetical protein  31.11 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.524516  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08311  hypothetical protein  18.42 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165507 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0124  hypothetical protein  34.91 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1232  hypothetical protein  30.93 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000655533  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1945  hypothetical protein  27.83 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.88314  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0220  hypothetical protein  37.14 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.231447 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0026  hypothetical protein  25.55 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.859068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0038  hypothetical protein  24.26 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>