42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1224 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1224  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  167  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3322  hypothetical protein  97.53 
 
 		 79 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443037  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2377  hypothetical protein  75.31 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2257  hypothetical protein  74.07 
 
 		 80 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0271155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5681  hypothetical protein  74.07 
 
 		 80 aa  123  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150981  normal  0.858407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2108  hypothetical protein  87.65 
 
 		 74 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.22897 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2361  hypothetical protein  72.84 
 
 		 80 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1726  hypothetical protein  72.84 
 
 		 80 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2338  hypothetical protein  72.84 
 
 		 80 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0939  hypothetical protein  70.13 
 
 		 77 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.02047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0959  hypothetical protein  71.79 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.134343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1943  hypothetical protein  66.67 
 
 		 79 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0293  hypothetical protein  66.67 
 
 		 79 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.984016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1171  hypothetical protein  66.67 
 
 		 79 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0222478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1163  hypothetical protein  66.67 
 
 		 79 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1010  hypothetical protein  66.67 
 
 		 79 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.652393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1322  hypothetical protein  66.67 
 
 		 79 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0855  hypothetical protein  66.67 
 
 		 79 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6400  hypothetical protein  56.14 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916024  normal  0.116761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4493  hypothetical protein  44.26 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4526  hypothetical protein  58.49 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0790  hypothetical protein  46.03 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4478  hypothetical protein  47.62 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1446  hypothetical protein  48.44 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.55376  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5821  hypothetical protein  54.17 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3901  hypothetical protein  46.77 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3933  hypothetical protein  48.39 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3820  hypothetical protein  48.39 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432882  normal  0.337677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0075  hypothetical protein  47.54 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.398237  normal  0.423709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1358  hypothetical protein  38.89 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0282  membrane protein  54.76 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0723  hypothetical protein  40.32 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1571  hypothetical protein  41.51 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.665593 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1076  hypothetical protein  42.22 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000323708  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2470  hypothetical protein  52.27 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0836129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2362  hypothetical protein  54.05 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.910987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6998  hypothetical protein  40.43 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.813818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4609  hypothetical protein  31.58 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0063  hypothetical protein  42.11 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1922  hypothetical protein  44.83 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2025  hypothetical protein  51.28 
 
 		 58 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2952  hypothetical protein  35 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>