16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0158 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0158  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0445  hypothetical protein  59.86 
 
 
286 aa  315  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122725  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6343  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.93 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.460291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.52 
 
 
281 aa  59.3  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 
249 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.07 
 
 
360 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  31.89 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 
359 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.89 
 
 
256 aa  46.2  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.85 
 
 
360 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  29.44 
 
 
264 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  30.65 
 
 
268 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.61 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  31.61 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  22.81 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>