30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2373 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  263  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3358  BA14K family protein  70.42 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  39.01 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  47.46 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  69.7 
 
 
235 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  60 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1649  hypothetical protein  35.42 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.989787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  50 
 
 
210 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  66.67 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  62.86 
 
 
209 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  66.67 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  47.62 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  61.29 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0987  hypothetical protein  55.17 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.283754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  51.43 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  66.67 
 
 
223 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  47.27 
 
 
141 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  66.67 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  47.27 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  47.27 
 
 
139 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  51.43 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2239  hypothetical protein  44.74 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  65.38 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_004310  BR1516  hypothetical protein  31.91 
 
 
169 aa  43.5  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  61.54 
 
 
230 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1466  hypothetical protein  45 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0685  hypothetical protein  72 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504453  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  53.57 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  61.54 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>