25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17500 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17500  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  250  5.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0934  hypothetical protein  43.59 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.860281  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04280  hypothetical protein  40.3 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0767  hypothetical protein  60 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0807  secreted protein  27.72 
 
 
110 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1190  hypothetical protein  35.23 
 
 
101 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0980  hypothetical protein  32.65 
 
 
106 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0299177  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0871  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6840  secreted protein  36.17 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3797  hypothetical protein  45.28 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1804  hypothetical protein  47.62 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0485  hypothetical protein  36.84 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2357  hypothetical protein  43.33 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3183  hypothetical protein  34.48 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3420  hypothetical protein  45.28 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26160  hypothetical protein  37.68 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0260  hypothetical protein  38.46 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3199  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000230213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6546  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0240638  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13830  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381398  normal  0.46801 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02490  hypothetical protein  27.93 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.795101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6639  hypothetical protein  47.62 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1937  hypothetical protein  52.94 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20896  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  38.46 
 
 
486 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1316  hypothetical protein  42.31 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>