22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16270 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16270  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  184  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.020473  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2252  hypothetical protein  50.72 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1475  hypothetical protein  56.9 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.707242  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1816  hypothetical protein  60 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.707667  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21020  hypothetical protein  53.12 
 
 
66 aa  70.5  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.606527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2014  hypothetical protein  58.62 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2164  hypothetical protein  49.18 
 
 
77 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0247439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1907  hypothetical protein  47.46 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000016688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2785  hypothetical protein  57.41 
 
 
61 aa  63.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.778108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9224  hypothetical protein  52.54 
 
 
61 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11780  hypothetical protein  45.16 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.166169  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3470  hypothetical protein  50.85 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.599905  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4546  hypothetical protein  45.76 
 
 
61 aa  53.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3527  hypothetical protein  45.76 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20050  hypothetical protein  42.31 
 
 
75 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408374  hitchhiker  0.00194499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2315  hypothetical protein  46.3 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.626905  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2654  hypothetical protein  43.4 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00923338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2436  hypothetical protein  41.51 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2656  hypothetical protein  44 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2621  hypothetical protein  39.34 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2771  hypothetical protein  37.74 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00046183  hitchhiker  0.000158734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2161  hypothetical protein  44.9 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>