31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15570 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  100 
 
 
209 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  38.94 
 
 
209 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  39.2 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  37.75 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  35.9 
 
 
206 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  37.07 
 
 
205 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  37.07 
 
 
205 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  39.27 
 
 
209 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  36.1 
 
 
205 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  35.12 
 
 
207 aa  99  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  39.81 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  35.58 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  32.02 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  34.78 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  37.31 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  38.92 
 
 
207 aa  89  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  36.32 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  33.82 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  37 
 
 
203 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  38.5 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  35.32 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  31.68 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  33.18 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  33.97 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  34.6 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  38.76 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  33.16 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  31.36 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  32.5 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  27.83 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>