18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08550 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08550  ThiS family protein  100 
 
 		 100 aa  193  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.266586  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  44.83 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  44.83 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  44.83 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  41.98 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  38.27 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  41.46 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  40.48 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1443  thiamineS protein  43.48 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1439  thiamineS protein  55.81 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0227652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  42.17 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0356  thiamineS protein  45.61 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  43.37 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0454  thiamineS protein  47.54 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132954  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  43.62 
 
 		 103 aa  42  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2736  putative molybdopterin converting factor  41.98 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  42.37 
 
 		 100 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  40.74 
 
 		 94 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>