28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0247 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0247  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2427  hypothetical protein  44.23 
 
 
265 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1483  hypothetical protein  33.47 
 
 
250 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0967  hypothetical protein  39.52 
 
 
260 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4569  hypothetical protein  36.63 
 
 
241 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2861  hypothetical protein  34.58 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613567  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0297  hypothetical protein  36.07 
 
 
284 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246483  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2011  hypothetical protein  39.18 
 
 
254 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0115  hypothetical protein  34.65 
 
 
254 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2069  hypothetical protein  37.74 
 
 
277 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1493  hypothetical protein  39.29 
 
 
262 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3192  hypothetical protein  39.75 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157621  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2527  hypothetical protein  38.61 
 
 
293 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35785  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2627  hypothetical protein  38.55 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.433366 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3066  hypothetical protein  37.72 
 
 
273 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3920  hypothetical protein  37.72 
 
 
264 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1536  hypothetical protein  37.72 
 
 
273 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3304  hypothetical protein  37.72 
 
 
264 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0123  hypothetical protein  37.72 
 
 
280 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3001  hypothetical protein  37.72 
 
 
273 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1830  hypothetical protein  34.4 
 
 
284 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3992  hypothetical protein  36.84 
 
 
264 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0282  hypothetical protein  34.5 
 
 
226 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7643  hypothetical protein  34.91 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0242  hypothetical protein  34.5 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5347  hypothetical protein  31.82 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.7075  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3259  hypothetical protein  32.69 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5040  hypothetical protein  39.66 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.12957  hitchhiker  0.00322129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>