40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4127 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4127  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  92.37 
 
 
236 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  92.7 
 
 
233 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  92.27 
 
 
233 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  93.69 
 
 
236 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  93.69 
 
 
236 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2379  hypothetical protein  88.69 
 
 
236 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323215  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  70.26 
 
 
237 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  71.49 
 
 
237 aa  321  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  71.04 
 
 
237 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  71.04 
 
 
237 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  71.04 
 
 
237 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  71.04 
 
 
237 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  71.04 
 
 
237 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  67.02 
 
 
234 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  66.5 
 
 
234 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0687  putative transmembrane lipoprotein  59.57 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  45.3 
 
 
222 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  45.15 
 
 
222 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  47.37 
 
 
213 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  42.27 
 
 
223 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  42.52 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  33.99 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4994  putative lipoprotein  32.73 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2547  hitchhiker  0.00226373 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1658  putative lipoprotein  30.91 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2635  putative lipoprotein  33.89 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1458  putative lipoprotein  32.78 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0925  putative lipoprotein  32.78 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0739  putative lipoprotein  32.78 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1844  putative lipoprotein  32.78 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1689  putative lipoprotein  32.78 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1667  putative lipoprotein  32.78 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801077  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0424  putative lipoprotein  32.78 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  25.57 
 
 
232 aa  58.9  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4583  hypothetical protein  29.19 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1358  hypothetical protein  29.61 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234925  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0957  hypothetical protein  27.89 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1439  hypothetical protein  27.89 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1417  hypothetical protein  26.11 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1876  hypothetical protein  27.59 
 
 
204 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>