14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6696 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5853  late embryogenesis abundant protein  100 
 
 
180 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6220  late embryogenesis abundant protein  100 
 
 
180 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767895 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6696  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106983  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6625  hypothetical protein  92.22 
 
 
180 aa  206  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.267734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5980  late embryogenesis abundant protein  83.87 
 
 
185 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5336  hypothetical protein  75.42 
 
 
176 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608769 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5735  late embryogenesis abundant protein  88.04 
 
 
183 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.15582  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1052  hypothetical protein  50.28 
 
 
133 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535898  normal  0.544948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0969  hypothetical protein  44.38 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0973  hypothetical protein  43.82 
 
 
136 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0774805  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2210  hypothetical protein  46.99 
 
 
151 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0372945  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0401  17 kDa surface antigen  32 
 
 
385 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0799  putative signal peptide protein  55.81 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4206  hypothetical protein  45.2 
 
 
217 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00215407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>