41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0975 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  98.2 
 
 
236 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  98.2 
 
 
236 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  92.37 
 
 
233 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  91.1 
 
 
233 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4127  hypothetical protein  93.69 
 
 
232 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2379  hypothetical protein  87.95 
 
 
236 aa  362  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323215  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  69.75 
 
 
237 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  70.22 
 
 
237 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  69.78 
 
 
237 aa  314  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  69.78 
 
 
237 aa  314  9e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  69.78 
 
 
237 aa  314  9e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  69.78 
 
 
237 aa  314  9e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  69.78 
 
 
237 aa  314  9e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  64.43 
 
 
234 aa  261  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  64 
 
 
234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0687  putative transmembrane lipoprotein  60.17 
 
 
233 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  46.91 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  45.05 
 
 
222 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  46.19 
 
 
222 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  41.84 
 
 
223 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  42.25 
 
 
216 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  34.3 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4994  putative lipoprotein  31.95 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2547  hitchhiker  0.00226373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2635  putative lipoprotein  33.71 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1458  putative lipoprotein  32.58 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0925  putative lipoprotein  32.58 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1844  putative lipoprotein  32.58 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0739  putative lipoprotein  32.58 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1689  putative lipoprotein  32.58 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1667  putative lipoprotein  32.58 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801077  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0424  putative lipoprotein  32.58 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1658  putative lipoprotein  29.14 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4583  hypothetical protein  25.88 
 
 
204 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  25.71 
 
 
232 aa  55.1  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0957  hypothetical protein  26.37 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1439  hypothetical protein  26.37 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1417  hypothetical protein  26.37 
 
 
204 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1358  hypothetical protein  29.78 
 
 
204 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234925  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1876  hypothetical protein  25.84 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318105 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1319  hypothetical protein  28.09 
 
 
204 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>