32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1344 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6485  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  243  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0097127  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1344  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  243  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.431742  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6075  hypothetical protein  96.77 
 
 
124 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0756645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5608  hypothetical protein  82.79 
 
 
118 aa  191  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6338  hypothetical protein  81.97 
 
 
118 aa  189  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864224  normal  0.10452 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5478  hypothetical protein  79.51 
 
 
118 aa  184  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2289  hypothetical protein  75.76 
 
 
175 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3110  hypothetical protein  75.76 
 
 
125 aa  146  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2985  hypothetical protein  75.76 
 
 
125 aa  146  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1333  hypothetical protein  75.76 
 
 
293 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.784002  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4511  hypothetical protein  76.47 
 
 
109 aa  139  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19335  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5292  hypothetical protein  69.66 
 
 
142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.109135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5447  hypothetical protein  68.54 
 
 
129 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1159  hypothetical protein  68.54 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4293  hypothetical protein  65.52 
 
 
95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3717  hypothetical protein  69.32 
 
 
95 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5768  hypothetical protein  54.95 
 
 
109 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.959428 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6781  hypothetical protein  61.11 
 
 
96 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406722  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4202  hypothetical protein  68.97 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4312  hypothetical protein  68.97 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257675  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0793  hypothetical protein  66.67 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.321671  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1295  hypothetical protein  58.7 
 
 
92 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920283  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4526  hypothetical protein  55.88 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.540117 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1598  hypothetical protein  55.56 
 
 
92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.215399  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5906  hypothetical protein  63.86 
 
 
110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00670  hypothetical protein  54.55 
 
 
122 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1063  hypothetical protein  61.11 
 
 
104 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.513514  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0837  hypothetical protein  56.67 
 
 
100 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2153  hypothetical protein  54.88 
 
 
94 aa  94  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2127  hypothetical protein  52.44 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1866  hypothetical protein  64.71 
 
 
75 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3634  hypothetical protein  57.69 
 
 
54 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00027053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>