48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1183 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1663  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1183  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1637  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  95.33 
 
 		 108 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1581  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  84.11 
 
 		 108 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.285184 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4811  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  87.62 
 
 		 107 aa  194  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1562  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  82.24 
 
 		 108 aa  190  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3428  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  74.29 
 
 		 107 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7132  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  78.5 
 
 		 109 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0006  hypothetical protein  71.43 
 
 		 107 aa  166  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0720243  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1644  protein tyrosine phosphatase-like protein  63.55 
 
 		 107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.294535  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4802  hypothetical protein  61.11 
 
 		 109 aa  144  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44960  hypothetical protein  65.42 
 
 		 109 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1380  hypothetical protein  59.81 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3825  hypothetical protein  63.55 
 
 		 109 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3946  phosphatase  62.04 
 
 		 108 aa  137  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3461  hypothetical protein  51.89 
 
 		 109 aa  130  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3432  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  57.55 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.284191  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3038  hypothetical protein  57.69 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.959689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2559  phosphatase  55.45 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3543  hypothetical protein  55.66 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02886  phosphatase  55.88 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2810  hypothetical protein  56.73 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2929  hypothetical protein  53.85 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2603  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0718  hypothetical protein  45.79 
 
 		 107 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2721  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.08 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.203534  normal  0.0645973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3901  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.67 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0160871 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1082  hypothetical protein  45.79 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4974  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.38 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4364  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.34 
 
 		 115 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal  0.301624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1113  protein-tyrosine-phosphatase  39.81 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0174  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.88 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0497104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0189  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.88 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00160916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0181  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.88 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0174  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.83 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0119958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1065  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.24 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  30.11 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.05 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.72 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.11 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.03 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  32.56 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.56 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  31.87 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.56 
 
 		 146 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.56 
 
 		 146 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>