19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4515 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3853  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4515  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.028542  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5789  hypothetical protein  98.32 
 
 
179 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485812  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1335  hypothetical protein  88.83 
 
 
179 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5262  hypothetical protein  47.73 
 
 
179 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2708  hypothetical protein  33.71 
 
 
174 aa  97.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000631521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2527  hypothetical protein  33.7 
 
 
176 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3608  hypothetical protein  29.61 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0211  hypothetical protein  37.5 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677911  normal  0.283207 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5790  hypothetical protein  35.9 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3473  hypothetical protein  32.18 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0769  hypothetical protein  26.87 
 
 
197 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0443737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2526  hypothetical protein  27.86 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0193  hypothetical protein  31.55 
 
 
350 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.783579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0216  hypothetical protein  31.89 
 
 
350 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4868  hypothetical protein  27.57 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359447  unclonable  0.00000012465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0205  hypothetical protein  31.35 
 
 
350 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3258  hypothetical protein  23.12 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3020  hypothetical protein  23.12 
 
 
169 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>